之所以总说南京三大巨头，是因为南京留都的特色守备制度，它实际上分为内守备和外守备以及参赞机务。

内守备，就是南京镇守太监，由中官出任，最有名的南京镇守太监是郑和。

外守备一人，协同守备一人，皆武臣。

而文臣者，必是南京兵部尚书，并加“参赞机务”。

按照这个最初设置来看，仅仅只是“参赞机务”的南京兵部尚书的地位原本最低，但是跟北京方面一样，文臣地位提升之后，参赞机务的南京兵部尚书反而成了权力最重的那个人。