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第三十七章 孟德尔随机化(4 / 4)

作品:《走进生物学

参考着github上一些前人的代码,一顿CtrlC,CtrlV之后,陈飞吭吭哧哧地写完了所有代码。在经历了python界面一次一次error,debug之后,他终于能够让代码运行了。

“看看这数据,”陈飞盯着屏幕上弹出的结果,目光锐利。

经过多次随机化采样和差异基因分析,他成功筛选出了肝细胞癌中显著异常表达的基因。

其中,有几个基因的差异尤为显著,它们在癌症样本中被高度激活,而在健康对照组中几乎没有表达。

这种差异引发了陈飞的浓厚兴趣:“这些基因很可能就是肝细胞癌的核心驱动因素。”

他将这些基因一一标记出来,接下来,他还需要进一步确认这些基因的作用。

第四步:基因调控网络的构建

光有差异表达的基因还不够,陈飞知道,基因之间并不是孤立的,它们通过复杂的调控网络来共同发挥作用。

因此,系统让陈飞构建一个基因调控网络,以便找出那些真正推动肝细胞癌发展的“核心节点”。

基因调控网络可以看作是基因的“社交圈”,某些基因在网络中扮演着关键角色,它们通过调控其他基因的表达,最终影响疾病的发展。

找出这些关键基因,就像抓住了疾病的“领袖”。

“我们要找的就是这些领袖基因。”陈飞说着,将所有筛选出的差异基因输入到网络分析软件中。