在透明的水晶中，隐裂纹呈亮晶晶的片状。有时还会有晕彩效应。这些裂纹是水晶在生长过程中，遇到外力挤压而在内部产生的一些隐形裂纹，隐裂纹在芙蓉石、紫水晶、白水晶球及白水晶柱中都很常见。有的裂纹后来被物质填充。形成愈合的裂纹，也就是原来的裂纹又长住了。这种裂纹对水晶的影响相对要小一些。

2棉、云雾或渣状包裹体、杂质在透明水晶内部有雾蒙蒙的现象或是感觉里面像有棉絮状、渣状物质一样的包裹体，这些包裹体的存在，影响水晶的整体美观。

还有的水晶内局部含有黑斑或其他颜色的斑状物质，与水晶整体不协调，被视为水晶的杂质，有这种杂质的水晶是次品。

3裂纹:水晶形成后由于外力作用或某种人为原因使水晶产生大的裂隙或裂纹。这种裂纹有大有小，对水晶的影响也有大小之分。

4生长缺陷:水晶表面坑洼的地方，有的深。有的浅，这是水晶在成长过程中自然形成的，并非是人为造成的损伤。

缺陷位置本来包有其他矿物晶体，由于包裹体和水晶结合部位的结合力不强。当表面抛光时。矿体脱落，留下空位。这种缺陷在绿幽灵、钛晶、金晶上都比较常见。

5损伤:损伤是指水晶由于加工或不小心摔掉、碰撞等原因，人为造成的损坏。它可以是破口，也可以是凹坑等。

水晶的评价依据:对水晶进行评价主要依据其颜色、透明度、大小、净度、特殊图案及是否有光学效应等方面。以颜色纯正，浓度较高，内部无瑕为好。

种类上紫晶最贵，其次为黄晶、烟晶、无色水晶和芙蓉石。有特殊光学效应的水晶的价格更高。

1颜色、透明度:一般而言，紫晶和黄晶是水晶中价值较高的品种。两者进一步的分级是据其颜色的深浅。颜色较深的为a级，稍浅的为b级。

一般颜色较深的价格高。但要以不深暗为标准。颜色包括两种，一种是水晶本身的颜色，另一种是内部包裹体的颜色。

水晶本身的颜色要艳丽、纯正，分布要均匀，不能太深或太浅，如澳州玉、蓝玉髓、紫晶、黄水晶，其价格就高。

无色的水晶内含包裹体的颜色艳丽，其价格也高，如钛晶、绿幽灵、红兔毛。紫水晶一般以稍有云状物、颜色深紫、晶体通透的为上品。

按照透明度指标，水晶越透明，价格越高，好的透明的水晶加工出的成品晶莹剔透、光辉耀眼。

透明度高的水晶能提升颜色的艳丽，否则显得呆板无灵性。光学水晶要求全透明、无双晶、无杂质。工艺水晶要求透明、少裂、少瑕疵。熔炼水晶要求透明，可有较多裂纹。